Cydia系のアプリで有用なものを物色していたらmplayerというアプリを見つけました。
mpeg4、h.264、wmv、mp3、aac、wma、real mediaなどのフォーマットに対応していると書いてある気がします。
/private/var/mediaにファイルを置いて楽しんでください見たいな事が書いてあります。
準備をして起動してみましたが少なくとも私のipod touchのOS3.0では動かないです。
起動直後に落ちます。惜しい。以前のバージョンのOSでの稼動は不明ですが、早くOS3.0でも動くようにバージョンアップしてほしいですね。